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从 SMILES 到分子指纹：用 RDKit 把分子变成机器学习能读懂的向量

以 AI 制药平台项目为背景，梳理 SMILES、Mol 对象、Canonical SMILES、分子描述符、Morgan 指纹和 Tanimoto 相似度，理解 RDKit 如何把化学结构转成可用于检索、建模和预测的数字特征。

人工智能生物信息学AI制药

everything-claude-code 在 Codex 的应用：不要照搬全家桶，而是做一套更聪明的增强层

从 Codex 原生能力出发，拆解 everything-claude-code 中哪些规则、skills 和工作流值得迁移，哪些配置不应该原样照搬。

AI工具软件工程

Docker 入门：从镜像、容器到项目部署

面向第一次接触 Docker 的学习笔记，梳理镜像、容器、Dockerfile、常用命令、Nginx 反向代理和服务器部署流程。

软件工程DevOps

用MLP预测氨基酸亲疏水性：一个完整的机器学习小实验-PyTorch版

使用PyTorch构建MLP模型，结合RDKit Morgan指纹特征工程，通过留一交叉验证预测20种标准氨基酸的亲疏水性，覆盖数据处理、模型训练、正则化与评估的完整流程。

人工智能生物信息学

Mac在外网SSH绕过内网NAT的完整指北

无需公网 IP，通过 Tailscale 组建虚拟局域网，实现 Mac 远程 SSH 登录家里 Windows 主机的完整配置指南。

软件工程DevOps

AminoHydro Classifier：用 SMILES 和 MLP 判断氨基酸亲疏水性

基于 RDKit 提取 Morgan 指纹，使用 MLP 神经网络对氨基酸进行亲疏水性二分类的入门项目完整笔记

深度学习人工智能生物信息学

4月

AlphaFold：蛋白质结构预测的革命

介绍 AlphaFold 如何利用深度学习解决蛋白质折叠问题，以及它对生物制药的影响。

深度学习生物信息学

LangChain 实现 RAG 检索增强问答系统：两种 Agent 方案详解

基于 LangChain 最新 API，完整实现 RAG 智能检索问答系统，涵盖大模型配置、文档处理、向量入库及工具调用型与上下文注入型两种 Agent 方案的构建与选型。

Agent开发

LangChain 实现 PDF 检索：从文档加载到向量查询的完整流程

基于 LangChain 框架，完整讲解 PDF 文档加载、文本分片、向量转换、Chroma 向量库存储及多种检索方式的实现方法。

Agent开发

RAG 入门：用检索增强生成解决上下文限制与幻觉

从分片、索引、Embedding、召回、重排到生成，通俗讲清 RAG 的完整工作流与核心价值，适合理解文档问答系统的基础原理。

Agent开发

macOS 环境变量排查：解决 npm 全局命令 command not found

从 Claude CLI 安装后无法执行出发，梳理 zsh 与 bash 配置文件差异，并给出在 macOS 下修复 PATH 环境变量的实用方案。

随笔

4月

欢迎来到 AI × 生物制药博客

这是我的第一篇学习笔记，记录开启 AI 与生物制药交叉领域学习之旅的起点。

随笔

4月

Flutter vs React Native：跨平台移动开发框架深度对比与选型指南

深度对比 Flutter 与 React Native 两大跨平台框架，从语言特性、性能表现、UI 开发、生态社区等多维度分析差异，助你做出合适的技术选型决策。

SSM 框架学习笔记

Spring、SpringMVC、MyBatis 三大框架整合开发的核心知识点与实践总结

Tomcat + Servlet 基础入门：从环境搭建到请求响应全解析

系统讲解 Tomcat 服务器配置与启动、Servlet 开发与部署、生命周期管理、线程安全及 Request/Response/Cookie/Session/ServletContext 等核心对象的使用方法。

Vue3 与 TypeScript 全面学习笔记

涵盖 Vue3 核心特性、组合式API、Vue Router、TypeScript 类型系统及两者配合使用的完整学习笔记

JavaScript 原型与原型链详解

深入理解 JavaScript 原型机制，从构造函数、prototype、__proto__ 到完整原型链的工作原理

Vue3 框架设计与源码解析

从全局视角理解 Vue3 框架设计思想，涵盖声明式与命令式、运行时与编译时、编译器与渲染器的核心原理

基于浏览器的网络基本原理：从 DNS 解析到服务器响应的全流程

通俗易懂地讲解浏览器访问网页的完整网络流程，涵盖 DNS 解析、TCP 连接、HTTP 请求发送、服务器响应及负载均衡、缓存与 CDN 等优化机制。